El sistema de salud pública en Chile cubre al 75% de la población y, si bien es eficiente según muchos indicadores de salud, sufre de largas listas de espera, altas tasas de inasistencia de pacientes y una adopción relativamente lenta de avances clave en campos como la genómica, la investigación operativa y la ciencia de datos. La pandemia de COVID-19 también ha puesto de relieve muchos otros problemas que podrían beneficiarse de una perspectiva de modelado y análisis de datos. En los últimos diez años, varios equipos de CMM han invertido un gran esfuerzo en abordar problemas de salud, utilizando técnicas matemáticas diversas y complementarias. Debido a lo anterior, se ha creado una nueva línea de investigación llamada Salud Digital que unifica e impulsa estos esfuerzos.
Hemos identificado los siguientes temas de interés:
Gestión sanitaria
Planeamos colaborar con las partes interesadas pertinentes que buscan mejorar el acceso y la prestación de atención médica en el sistema público. Un ejemplo es el trabajo para mejorar la gestión de los horarios hospitalarios, a través de los acuerdos de colaboración que hemos firmado con tres importantes instituciones de salud pública en Chile y la financiación que hemos obtenido para un proyecto de dos años para desarrollar un prototipo de software que aborde la inasistencia a citas. Otro desafío es el sistema chileno de donación de órganos, que está experimentando una profunda reforma. Abordar el problema de la asignación de órganos de manera eficiente y justa requiere varias técnicas de diferentes áreas, como modelos de grafos aleatorios, técnicas de optimización combinatoria y análisis de datos.
Biomedicina
En biomedicina, nos centramos en el uso cada vez más frecuente de técnicas de imagen para apoyar el diagnóstico médico y la investigación biológica. Trabajamos para mejorar estas técnicas en la investigación cardíaca y pulmonar mediante modelos biofísicos apropiados, buscando una mejor comprensión de las matemáticas empleadas en las técnicas de microscopía de lámina de luz y en contribuciones matemáticas al desarrollo de nuevas técnicas para la detección temprana de la debilidad ósea a partir de mediciones ecográficas.
Procesamiento clínico del lenguaje natural
En el procesamiento del lenguaje natural clínico, nos centramos en la creación de recursos lingüísticos, en particular el primer corpus anotado a partir de narrativas chilenas. Además, trabajamos en la propuesta de modelos basados en redes neuronales para extraer información clave (reconocimiento de entidades nombradas). Nuestro caso de estudio es la lista de espera no GES en hospitales públicos chilenos, con el objetivo final de apoyar la toma de decisiones clínicas y automatizar el uso secundario de la información. Las directrices de anotación, las representaciones vectoriales de palabras, el texto anotado y un repositorio de código se pueden encontrar en nuestra página web.
Enfermedades infecciosas
Por otro lado, basándonos en la experiencia del grupo en la modelización de enfermedades infecciosas (dengue y ETS, entre otras), así como en su impacto en el comportamiento social (N1H1), el año pasado creamos un grupo de trabajo sobre COVID-19 en Chile. Hemos estimado el impacto de la aplicación de diferentes acciones de mitigación no farmacológicas en Chile, en particular en la demanda de camas hospitalarias (nuestros informes periódicos están disponibles en https://covid-19.cmm.uchile.cl/ ). Los miembros del CMM también participan en el panel de datos gubernamentales sobre COVID-19. Planeamos continuar trabajando en esta línea, especialmente en el desarrollo de enfoques costo-efectivos para la toma de decisiones, orientados a la prevención y el tratamiento, y en la correcta evaluación de sus impactos sociales.
Genómica de la salud humana
En el campo de la genómica de la salud humana , las nuevas tecnologías de secuenciación, junto con nuestras mejoras en los algoritmos de ensamblaje de genomas mediante bibliotecas híbridas, han permitido obtener genomas de casi cualquier especie a un costo muy bajo. En particular, hoy somos competitivos en el desarrollo de métodos de novo para ensamblar genomas humanos y otros más complejos a partir de secuencias cortas, con un costo de $5,000 o menos. Esto abre oportunidades, como el seguimiento funcional de células cancerosas a lo largo del tiempo. Se están llevando a cabo conversaciones avanzadas sobre esta idea con la Fundación Arturo López Pérez, una de las instituciones privadas de investigación del cáncer más importantes de Chile.
